Il fatto che le foto siano su un disco esterno potrebbe essere la causa. La connessione con il disco esterno è più lenta di quella con il disco interno.
Eventualmente, non ti serve eliminare le foto, basta che le dividi in cataloghi diversi.
Per quanto riguarda il backup, è sufficiente fare una copia della cartella che contiente le foto su un altro disco.
Per fare il backup del catalogo, devi fare una copia del file del catalogo che trovi guardando questo tutorial: http://www.fotocomefare.com/tutorial-lightroom-catalogo/